С 1555 по 1714 годы Фландрия находилась под господством испанцев. Современные испанские кинологи считают, что вместе с захватчиками из Ломбардии могли попасть и собаки, которые смешивались с местными собаками, а их потомки могли быть предками фландрских бувье. Другой автор, Дешамбр (Deschambre), придерживался мнения, что бувье произошли путем скрещивания гриффонов (жесткошерстные охотничьи и пастушьи собаки) со старотипными босеронами. Как бы то ни было, современный итальянский кинолог П. Манетти считает, что на формирование облика фландрского бувье повлиял, главным образом, особый климат Фландрии, который не отличается особо низкими температурами, однако чрезвычайно влажный и ветреный. В таких условиях грубый и непроницаемый густой волосяной покров бувье создавал ему очень хорошую защиту. Выносливость бувье определяли и спартанские условия содержания: собак на фермах плохо кормили, а их гигиене не уделяли никакого внимания. О том, чтобы соорудить собаке приличную будку, не было и речи. Некоторым бувье везло больше: их не привязывали на цепь, поэтому у них была возможность найти себе хотя бы подходящее укрытие от ветра и дождя. Однако и на цепи эти собаки даже в грозу предпочитали устроиться на крыше своей примитивной конуры, чтобы продолжать наблюдать за округой и охранять хозяйский двор. Даже современные бувье сохраняют эту особенность: невзирая на непогоду, они выбирают место повыше и устраиваются на своем посту.